汽车工程系是广州市蓝天技工学校近年投资升级改造的专业系部。现有汽车发动机、汽车底盘、汽车电器、汽车整车、汽车故障检测、汽车新技术等6个实训场室，配置有进口美系雪佛兰、日系丰田、德系欧宝、韩系现代以及国产东风等高档通用车型；购置有目前较先进的K-6900L车轮定位仪、LANHCH431汽车电脑检测仪、Q/NH4废气分析仪、点火正时检测仪、轮胎动平衡仪等检测设备设施。开设有汽车维修（中技层次）、汽车检测（高技层次）两个传统长线专业。现有专业班级15个，在校学生520余人，专兼职教师12人（均具备技师及其技师以上职业技能资格）。